Differentiation of pluripotent stem cells into functional thymic organoids for T cell maturation in vitro - Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie
Thèse Année : 2022

Différenciation de cellules souches pluripotentes induites en organoïdes thymiques fonctionnels pour la maturation de lymphocytes T in vitro

Differentiation of pluripotent stem cells into functional thymic organoids for T cell maturation in vitro

Résumé

The thymus is a primary lymphoid organ that plays a crucial role in establishingimmune tolerance. Thymocytes are selected by thymic epithelial cells (TEC).Congenital pathologies caused by a deficiency in the genes regulating thedevelopment or functionality of TECs result in defective immune balance andautoimmunity. The use of induced pluripotent stem cells (iPSc) for cell therapy is apromising approach to treat these pathologies. We describe here the production offunctional TECs derived from iPSc expressing AIRE and capable of supporting T cellgeneration in vitro. We have optimized a protocol for the generation of thymicepithelial progenitors (TECs) using a method based on optimal experimental designand transcriptomic profiling of the differentiation product. Our directed differentiationprotocol, based on the modulation of regulatory signaling pathways involved inthymic organogenesis, resulted in TEPs expressing thymic identity markers. We theninduced their maturation into TECs by 3D hydrogel coculture with human earlythymic progenitors (ETPs), resulting in the formation of thymic organoids. Theseorganoids support the maturation of ETPs into CD4 or CD8 single-positive T cells.The generation of functional TECs and thymic organoids provides a convenientplatform for the study of cellular interactions in the thymus and paves the way forfuture cellular therapies for autoimmune diseases.
Le thymus est un organe lymphoïde primaire qui joue un rôle crucial dansl'établissement de la tolérance immunitaire. Les thymocytes y sont sélectionnés parles cellules épithéliales thymiques (TEC). Certaines pathologies congénitales sontcausées par une déficience des gènes régulant le développement ou lafonctionnalité des TEC et entraînent un équilibre immunitaire défectueux et uneauto-immunité. L’utilisation de cellules souches pluripotentes induites (iPSc) pour lathérapie cellulaire est une approche prometteuse pour traiter ces pathologies. Dansces travaux, je décris la production de TECs fonctionnelles dérivés d'iPSc exprimantAIRE et capables de supporter la maturation de cellules T in vitro. Nous avonsoptimisé un protocole permettant la génération de progéniteurs épithéliauxthymiques (TEP) grâce à une méthode basée sur un design optimal d’expériences etun profilage transcriptomique complet du produit de différenciation. Notre protocolede différenciation dirigée, reposant sur la modulation des voies de signalisationrégulatrices de l'organogenèse thymique, a permis d'obtenir des TEP exprimant lesmarqueurs d’identité thymique. Nous avons ensuite induit leur maturation en TECpar une culture 3D dans un hydrogel en coculture avec des progéniteurs thymiquesprécoces (ETP) humains, ce qui a permis la formation d'organoïdes thymiques. Cesorganoïdes supportent la maturation des ETP en cellules T CD4 ou CD8simple-positives. La génération in vitro de TEC et d'organoïdes thymiquesfonctionnels offre une plateforme prometteuse pour l'étude des interactionscellulaires dans le thymus et ouvre la voie à la production de lymphocytes T pour defutures thérapies cellulaires des patients atteints de maladies auto-immunes.
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  • HAL Id : tel-04861105 , version 1

Citer

Nathan Provin. Differentiation of pluripotent stem cells into functional thymic organoids for T cell maturation in vitro. Médecine humaine et pathologie. Nantes Université, 2022. Français. ⟨NNT : 2022NANU1039⟩. ⟨tel-04861105⟩
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